阿奇霉素與克拉霉素都屬于大環內酯類抗菌藥物，這類藥物作用于細菌的核糖體，抑制細菌蛋白質的合成，屬于抑菌劑，這類藥物的抗菌譜比較窄，臨床主要用于治療如下感染

呼吸道感染

大環內酯類抗菌藥物對引起呼吸道感染常見的致病菌如肺炎鏈球菌，溶血性鏈球菌，流感嗜血桿菌，卡他莫拉菌都具有較好的抗菌活性。治療細菌性扁桃體炎、咽炎，可作為青霉素，頭孢菌素過敏患者的替代抗菌藥物，克拉霉素對于呼吸道感染的常見陽性球菌如肺炎鏈球菌，溶血性鏈球菌的抗菌活性更強，不容易產生耐藥，在治療咽炎，扁桃體炎，耳鼻喉感染等上呼吸道細菌感染中的療效優于阿奇霉素。而在社區獲得性肺炎的病原菌當中，肺炎支原體是重要的非典型致病菌，阿奇霉素對肺炎支原體的抗菌活性要高于克拉霉素，因此在治療肺炎支原體感染時，多數情況下首選阿奇霉素。雖然近年來肺炎支原體對大環內酯類的耐藥率逐年升高，大環內酯類藥物以不再作為治療支原體感染的首選用藥，其一線地位已經被左氧氟沙星等喹諾酮類藥物所取代，但在某些情況下，如對于兒童患者來說，由于喹諾酮類藥物禁用于18歲以下的未成年人，因此對于這部分人群，阿奇霉素等大環內酯類藥物依然是治療肺炎支原體感染的首選品種。

消化系統感染

在治療幽門螺桿菌感染的四聯方案中，克拉霉素與阿莫西林，四環素，甲硝唑，左氧氟沙星，呋喃唑酮等都是相關指南推薦的殺滅幽門螺桿菌的抗菌藥物品種，而阿奇霉素則沒有治療幽門螺桿菌的適應癥。急性細菌性感染性腹瀉的主要致病菌為沙門氏菌和志賀菌屬，其次還包括彎曲菌屬和產腸毒素的大腸埃希菌，雖然喹諾酮藥物是治療感染性腹瀉的首選抗菌藥物品種，但對于空腸彎曲菌導致的腹瀉，尤其是對于不能使用喹諾酮類藥物的兒童患者，阿奇霉素是唯一推薦的抗菌藥物品種，克拉霉素則不在推薦之列

泌尿生殖道感染

泌尿道感染常見的致病菌為大腸埃希菌，這是一類革蘭陰性菌，因此抗菌藥物應主要選擇對革蘭陰性菌具有較高抗菌活性的頭孢菌素類藥物或左氧氟沙星等喹諾酮類藥物，而對于沙眼衣原體導致的特異性尿道炎，宮頸炎等，阿奇霉素是首選推薦的品種。

除了在抗菌適應癥有所不同之外，阿奇霉素和克拉霉素在不良反應、用法用量也存在一定區別

不良反應

大環內酯啦藥物主要不良反應為惡心嘔吐腹瀉等胃腸道反應，除此之外，這類藥物的心臟毒性也日益受到臨床關注，阿奇霉素可導致心臟Q-T間期延長，心律失常患者慎用。而對于克拉霉素來說，同樣存在心臟毒性，FDA于2018年發布聲明，建議心臟病患者慎用克拉霉素，提示可能會增加心臟問題和死亡風險。此外，克拉霉素對肝藥酶的抑制作用更強，與其他藥物的相互作用更多，尤其是與地平類鈣通道阻滯劑降壓藥中的硝苯地平合用可引起急性腎損傷，與他汀類藥物也存在著有臨床意義的相互作用，因此克拉霉素應盡量避免與上述藥物聯合使用。

用法用量

阿奇霉素與克拉霉素都屬于時間依賴性抗菌藥物，抗菌作用的效果取決于藥物與致病菌接觸的時間，因此提倡將一日總劑量分次給與，在感染性疾病的治療中，阿奇霉素由于具有將近70小時的超長半衰期，抗菌作用維持時間長，因此一般情況下一天一次給藥即可，而克拉霉素則需要一天2次給藥。